Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam47eD3YWC7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms