Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm3259D3YUK0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm3259D3YUK0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm3259D3YUK0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm3259D3YUK0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm3259D3YUK0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm3259D3YUK0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm3259D3YUK0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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