Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms