Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrc5C3VPR6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms