Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smok3bC0HKC9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms