Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Phf11cB4XVP9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms