Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Siah3B2RWG3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms