Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms