Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zbed5B2RPU8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zbed5B2RPU8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zbed5B2RPU8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Zbed5B2RPU8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Zbed5B2RPU8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Zbed5B2RPU8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Zbed5B2RPU8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Zbed5B2RPU8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Zbed5B2RPU8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Zbed5B2RPU8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Zbed5B2RPU8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Zbed5B2RPU8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbed5B2RPU8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbed5B2RPU8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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