Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Uhrf1bp1B2KF50 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms