Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms