Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm2012B1B0R1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms