Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ssxb8B1AY40 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ssxb8B1AY40 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ssxb8B1AY40 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ssxb8B1AY40 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ssxb8B1AY40 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ssxb8B1AY40 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ssxb8B1AY40 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ssxb8B1AY40 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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