Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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H2-M5A7VMS3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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H2-M5A7VMS3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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H2-M5A7VMS3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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H2-M5A7VMS3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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H2-M5A7VMS3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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H2-M5A7VMS3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M5A7VMS3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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