Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms