Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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