Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2al1jA2BFR3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2al1jA2BFR3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms