Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Scn3aA2ASI5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Scn3aA2ASI5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Scn3aA2ASI5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Scn3aA2ASI5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Scn3aA2ASI5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn3aA2ASI5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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