Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Scn1aA2APX8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Scn1aA2APX8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Scn1aA2APX8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms