Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syndig1A2ANU3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms