Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptpn3A2ALK8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptpn3A2ALK8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms