Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms