Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp8nlA2ABX0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms