Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm27029A2A4P4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms