Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav12-2A0N8N6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms