Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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