Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2210011C24RikA0A087WQ89 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms