Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Speer3W4VSP1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Speer3W4VSP1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms