Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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