Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Knop1Q9Z2Q2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms