Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms