Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms