Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Setbp1Q9Z180 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setbp1Q9Z180 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms