Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sumo3Q9Z172 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Sumo3Q9Z172 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sumo3Q9Z172 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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