Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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Sh3bp5Q9Z131 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Sh3bp5Q9Z131 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Sh3bp5Q9Z131 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms