Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms