Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hmg20bQ9Z104 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms