Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13bQ9WU72 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms