Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn4Q9WU22 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms