Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubd1Q9R1K7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubd1Q9R1K7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms