Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms