Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms