Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms