Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr2e3Q9QXZ7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms