Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nufip1Q9QXX8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms