Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cpsf3Q9QXK7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpsf3Q9QXK7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms