Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msh5Q9QUM7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Msh5Q9QUM7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms