Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PolkQ9QUG2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms