Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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