Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccr10Q9JL21 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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